Ameaçado de perder seu status de proteção, o Parque Estatal Cristalino II corre o risco de ser desmatado para a retirada ilegal de árvores, o cultivo de soja, a criação de gado, a mineração e por outros interesses de grileiros que invadem terras públicas. Imagens de satélite mostram que uma área de mais de 10.000 hectares foi queimada em 2022. Além disso, foram apresentados pedidos de pelo menos 10 licenças para prospecção de garimpo dentro da área do Parque. O custo para a sociedade, em termos de recursos naturais, biodiversidade, sequestro de carbono e serviços ambientais, traria danos irreparáveis e uma das mais graves perdas da biodiversidade brasileira.